mada
Analysis:
Diagnostic Test Accuracy (DTA)研究のメタアナリシス。 Bivariate modelによる感度・特異度の統合値と信頼区間、Summary ROC曲線のプロット。
感度、特異度のForest plot、Diagnostic Odds Ratio (DOR)のForest plot、DORのメタアナリシスの統合値、I二乗値、Q統計値のコンソールへの出力、 Summary ROCのプロット、Proportional hazards modelによるSROCのプロットとAUC、pAUCと95%信頼区間の値のコンソールへの出力。
解析終了後、クリップボードに各研究の感度、特異度、陽性尤度比、診断オッズ比(DOR)と95%信頼区間の値、およびそれぞれの統合値とAUCと95%信頼区間の値、pAUCと95%信頼区間の値を格納してあるので、そのまま貼り付けられます。一番下の行が統合値と95%信頼区間の値で、AUC, pAUCは一番下の行のみです。
Dependent package:
"mada"
Author of mada : Philipp Doebler.
Data:
データを一定の形式でExcelで用意する。解析実行の際には、データ範囲をコピーして、Rに戻り、Rエディタ中のスクリプトを実行する。
names TP FP FN TN Theron 2013 154 27 31 517 Malbruny 2011 12 0 0 46 Boehme 2011e 101 16 0 671 Boehme 2011b 171 3 6 825 Boeheme 2010b 201 0 8 101 Ciftci 2011 24 1 1 59 Boehme 2010e 179 0 8 35 Bowles 2011 60 2 4 23 Boehme 2010c 136 1 10 185 Miller 2011 27 2 2 58 Boehme 2011e 136 5 12 234 Ioannidis 2011 29 2 3 32 Teo 2011 56 2 6 42 Hanif 2011 54 0 6 146 Marlowe 2011 116 4 14 82 Boehme 2011a 203 4 26 303 Zeka 2011 31 0 4 68 Scott 2011 58 3 9 104 Boehme 2011c 201 2 32 669 Rachow 2011 49 1 9 101 Boehme 2010d 36 3 7 215 Boehme 2011a 123 1 24 68 Boehme 2011d 121 0 24 144 Helb 2010 67 0 15 25 Theron 2011 111 19 30 320 Moure 2011 61 0 17 29 Lawn 2011 42 2 30 320
*青のボタンをクリックして、Excelに貼り付ける(Ctrl+V)と形式を確認のこと。
Output:
Forest plot、SROC plotの例(サンプルデータとは異なる解析例です)。